回到蓝顶堡后，林清玄考虑着全真弟子以后要在西域传道修行，这护教武功需得再加强一二。
如今明教和拜火教、穆尔洁净派都已经被剿灭，即便是天方教剩余诸派不敢招惹全真教，但时间长了弟子多了，难免会有人与当地武林发生摩擦，到那个时候只能看这些弟子自己的本事。
林清玄想着西域武功,自有独到之处，尤其是交手时招法怪异，威力极大。
若全真弟子武功练得不到家遇到西域武林中人，多半要吃亏，于是就根据自己所悟，以全真武学和心法为根基，再以自己所学所知的西域最上乘武学功法为依据,创出了一些破解和克制西域武功的高明武功，并且把武学招式和心法等编撰成一部武经，考虑到是全镇玉清宫未来镇压西域武林所用，所以就取名曰：“玉清斩魔经”。
这部斩魔经可以说是中西合璧，其中内功心法是一篇速成可以克制西域魔功的内功心法的，更多的则是克制西域拳脚武器各方面武功的剑法、掌法、指法、身法等。
林清玄初创玉清斩魔经后又觉得这门功法太过速成，所以门下弟子急功近利，一味贪快，时间一长玉清宫门下全真弟子怕要都主修此功，忘了全真大道歌这门天下第一筑基玄功了。
所以林清玄又闭关三日，对“玉清斩魔经”中的“九转玉清功”重新研创，最后算是又加入了先天功的不少精要，这部林清玄所创既能速成又可与全真大道歌相辅相成的九转玉清功最终大功告成。
这门内功心法可分修阴阳二气，一一修炼自然进步极快，等到两气相融之时却是必须要有全真心法予以中和，所以这才能使玉清宫的全真弟子不至于未来失了全真真传正法，若是和全真心法相结合修炼，等到练到第九重天时便可有当世大宗师的功力，算是全真教内尤胜金关玉锁二十四诀，堪比先天功的另一部最上乘道家真功。
在林清玄的打算里,西域玉清宫的全真弟子只需要把《玉清斩魔经》练的小成后便足以应付寻常的西域武林中人，若是天分高些或者勤修苦练，自然能够修为高深，到那时候只需练到第四转五转时便是遇到西域的一流高手也足以自保了。
林清玄好不容易创出了一套神功，出关后就先把《玉清斩魔经》取出来和丘处机、郝大通一起精研讲解。
这两道的武功在中土已经仅次于四大宗师，在江湖一流中也属第一档，丘处机和郝大通两道也是和三大教高人交过手，更吃过大亏，近两个月脑中也是一直揣摩西域武功，想着下次遇到了当如何应对。
此时听讲了林清玄的《玉清斩魔经》都大感豁然开朗，稍加修炼便知道林清玄所创真经中的武功确实是克制着西域的武学，同时明白这部武典足以成为玉清宫的镇宫武学了，若是门下弟子都能勤而修之，不出十年，西域方圆万里将没有什么门派能比的上玉清宫了。
两位真人心中欢喜，当即各自抄录一份，准备带回重阳宫完善藏经阁的全真武藏。
十年已过,全真七子勤修先天功,虽然个人根底不同无法将先天功全部参悟修行，但是他们另辟蹊径，以自己对先天功的理解和多年修持的全真心法为根基，却是百花齐放，每一位真人都各自创出了一套武功。
丘处机所创的是《龙门玄真诀》，王处一所创的为《玉阳脱枷法》，郝大通所创的叫做《紫气东来功》
其余诸子也有独门功法，马钰在三子西行前就把本门武学一一编纂成册收录进重阳宫藏经阁，经过简单清点，如今全真绝学玄功足有二十一部，若是“玉清斩魔经”再能传回中土便又添一部。
全真教自创教伊始，发展至今，在十余年内发展壮大，不仅成了道门魁首，天下第一大派，便是本门的道家武学也发展壮大，有了与天下第一大派，天下武学正宗名头相同的底蕴了。
那少林寺号称天下武学之源，以少林七十二绝技闻名数百年，如今全真教有二十二部上乘玄门武典，虽数量上不及少林，但质量上绝对不会逊色。
林清玄除了为玉清宫弟子传授《玉清斩魔经》，每日还要为王处一渡气疗伤，除了这两件事剩余时间便是静修玄功。
至于玉清宫修缮的诸多事宜则全权交给尹克西来办，尹克西早就寻觅好能工巧匠开始修缮，不过便是不惜重金，玉清宫最快也要明年方可重新建成。
到那个时候，林清玄和全真三子都已回转中土，可是西域全真教却也需要一个主事之人，这人不仅需要武功高强，还得善于经营的主事之人。
在林清玄和丘处机三子商讨许久后，最终还是决定，等到玉清宫修好后，暂时让尹克西任宫主处理西域教务。
等到自己和全真三子回转中土后，再从三代弟子中寻觅武功高强道法精深的弟子派往西域接手，毕竟全真教如今挣钱的大头乃是丝绸之路的免税生意，这条商道又是尹克西负责，他若是专心做玉清宫主反倒对全真教经济上会造成重大的损失。
转眼已是十月，这一日林清玄正在蓝顶堡大殿内为众弟子讲说“玉清斩魔经”上的武功心法，忽然见尹克西快步进殿，脸上还有焦急惶然之色。
因为尹克西要专心主持玉清宫重建事宜，所以最近很少露面，一直是在萨维兰山上忙碌，此时突然出现让林清玄眉头一皱，当即把“玉清剑法”的十二个杀招说完，吩咐众弟子揣摩演练，他则起身出了大殿。
尹克西迎过来躬身道：“师父，刚才弟子得到消息，窝阔台王子在东欧的梁赞安排军务时被人刺杀了，是被人割去首级，至今也不知所踪，现在是贵由王子和蒙哥王子在梁赞和基辅主持大局。
可是大汗跟窝阔台王子相继去世，尤其是统御西域的窝阔台王子更是被人刺杀了，这个消息已经传播了出去，不仅各地的色目人和胡人有些不安分，就是镇守各部的蒙古统帅也人心浮动，怕是要乱。”
林清玄闻言心中一惊，不过旋即压下杂念，面上却神色不动。